台灣事實查核中心自 2018 年成立以來，主要仰賴民間企業贊助，刻意與政府保持財務距離。其中 Meta 約佔 2025 年預算一半、Google 則超過 3 成，屬兩大金主。Meta 行政總裁朱克伯格（Mark Zuckerberg）早前宣布停止與美國事實查核機構合作，外界視為降低美國內政與言論審查爭議的政治風險，亦擔心此策略延伸至包括台灣在內的海外合作夥伴。綜合報導與中心說法，若 Meta 不續約，現行商業模式恐難維持既有查核量與人力配置。
台灣事實查核中心行政總裁邱家宜公開表示，按目前情況與 Meta 合約「可能」在 2026 年 1 月到期，續約充滿不確定。中心已主動與 Meta 接洽惟未獲明確承諾。外電報導多以「可能撤資」或「資金威脅」形容，顯示風險真實存在，但尚未到 Meta 正式公告終止合作階段。最悲觀情境下，若 2026 年 1 月合約期滿不續簽，且國內企業捐助未能及時補位，中心或被迫縮編甚至關閉部分服務。
研究機構 V-Dem 長期指出，台灣連續多年成為全球假訊息攻擊最嚴重國家之一，多數來源指向中國大陸。目前事實查核中心每日處理約 200 至 300 則來自社群使用者通報的疑似假訊息，由 14 名具媒體背景成員按公共利益與傳播速度編排優先次序，運作上壓力甚大。一旦縮減編制，原本能及早揭露的詐騙、政治謠言內容，或會在社群停留更久、被更多人轉傳。不過假訊息是否「一定變更多」，仍受平台自動偵測機制、政府識詐宣導與民眾媒體素養變化等多重因素影響，難直接與單一機構存亡畫上等號。
台灣官方認可備用查證管道
台灣法務部調查局整理「假訊息查證參考資訊」，列出多個具公信力查證窗口，包含以下服務，可視為官方背書的「備用」與「並行」管道：
TFC 台灣事實查核中心
官方網站可直接搜尋過往查核報告，亦能透過 LINE 官方帳號傳送圖文、連結請求查證，屬目前結構最完整查核資料庫之一。
LINE 訊息查證
LINE 自建查證入口，後端與多個查核單位合作（包括台灣事實查核中心、MyGoPen、蘭姆酒吐司、CoFacts 真的假的），用戶只需把群組或對話中的可疑訊息轉傳給此官方帳號，即能收到比對結果或相關查核報告連結。
蘭姆酒吐司
長期專注拆解網絡謠言與詐騙說法，透過公開資料佐證、邏輯分析等方式發布查核文章，同時亦提供 LINE 帳號讓民眾投稿求證。
MyGoPen
2015 年成立，名稱取台語「麥擱騙」，初時專注協助長者辨識網絡謠言，近年亦與社群平台與通訊軟件合作，並加入國際事實查核聯盟 IFCN 增強專業度。
其他公部門匯整入口
各縣市警察局「識詐宣導專區」通常會整理上述查核平台與 LINE 官方帳號連結，方便民眾一站式尋找查證資源。
資料來源：風傳媒、TVBS、Taipei Times
